Die Orgel der Jesuitenkirche La Merced in Burgos wurde von der Firma Mutin-Cavaillé-Coll geliefert und 1905 eingeweiht.

Am 21. April 2001 wurde das Instrument bei einem Kirchenbrand schwer beschädigt. Ein Kurzschluß hatte zuvor den Brand des neugotischen Hochaltars ausgelöst. In Folge der enormen Hitzeentwicklung brach im Chorraum das Gewölbe ein. Der eintretende Sauerstoff erzeugte eine gewaltige Stichflamme, die am Kirchengewölbe entlang bis zur Orgel züngelte. Hierdurch wurden die oberen Enden Metallpfeifen des Hauptwerks abgeschmolzen. Pfeifenfüße und Labien blieben teilweise unversehrt, das Schwellwerk wurde nicht beschädigt.

Die Firma Gerhard Grenzing restaurierte die Orgel in den darauffolgenden Jahren und stellte den originalen Zustand wieder her. Sämtliche Prospeltpfeifen mußten dabei erneuert werden. Die Intonation der neuen Pfeifen konnte sehr gut an die der alten Pfeifen angepaßt werden.